Journal de génomique clinique

À l’échelle du génome

Un réseau métabolique à l'échelle du génome de réactions chimiques qui ont lieu à l'intérieur d'un organisme vivant est principalement reconstruit à partir des informations présentes dans son génome et implique des étapes telles que l'annotation fonctionnelle du génome, l'identification des réactions associées et la détermination de leur stœchiométrie, affectation de localisation, détermination de la composition de la biomasse, estimation des besoins énergétiques et définition des contraintes du modèle. Ces informations peuvent être intégrées dans un modèle stœchiométrique du métabolisme qui peut être utilisé pour une analyse détaillée du potentiel métabolique de l'organisme à l'aide d'approches de modélisation basées sur les contraintes et est donc utile pour comprendre ses capacités métaboliques.