Journal de physiologie et pathologie végétales

Génotypage par séquençage et résistance à la rouille du matériel génétique du blé dur d'Azerbaïdjan

Mehraj Abbasov1*, Jighly Abdulqader2,3,4, Zeynal Akparov1, Khanbala Rustamov1, Sevda Babayeva1, Vusala Izzatullayeva1, Natavan Kalantarova1, Elchin Hajiyev1, Parviz Fatullayev5, Sezai Ercisli6, Robert Bowden7, John Raupp8, Sunish Sehgal9, Jessy Pologne8, Bikram Gill8

Le génotypage par séquençage (GBS) est une méthode de criblage génétique permettant de découvrir et de génotyper de nouveaux polymorphismes nucléotidiques simples (SNP) dans les génomes et les populations de cultures. Dans le cadre de la recherche actuelle, une évaluation phénotypique et génotypique de 76 accessions de blé dur (Triticum durum Desf.) d'origine azerbaïdjanaise a été réalisée à l'aide de six traits phénotypiques et de la technologie GBS. Après un criblage de la résistance à la rouille des feuilles et de la tige au stade plantule, 16 génotypes ont affiché une résistance à la rouille des feuilles et 14 à la rouille de la tige. Certaines relations ont été trouvées entre la résistance à la rouille des feuilles et les traits phénotypiques des variétés botaniques. La corrélation de Pearson la plus élevée (r = 0,53 ; p < 0,001) a été notée entre la couleur de l'arête et la pubescence. Les génotypes de blé dur se répartissent en quatre groupes principaux dans la carte thermique groupée ; groupés selon la variété botanique. Un total de 748 marqueurs SNP ont été obtenus pour la collection. Français Le contenu moyen en informations polymorphes et l'indice de diversité génétique pour l'ensemble de la collection étaient respectivement de 0,329 et 0,420. En ce qui concerne la structure de la population, deux et trois sous-populations ont été identifiées. Les analyses en composantes principales et en grappes ont donné des résultats très comparables à l'analyse de la structure de la population à k = 3. L'analyse de grappes basée sur les données GBS a montré que les génotypes étaient divisés en six grappes. Une certaine cohérence a été notée entre le regroupement des génotypes et leurs pedigrees, et la variété botanique. Les résultats pourraient faciliter la collecte, la conservation et la sélection du blé dur et ouvriront la voie à de futures études de cartographie d'association. De plus, les génotypes résistants peuvent être utilisés comme donneurs pour élargir la base génétique de la résistance à la rouille dans la sélection du blé.