Panchsheela Nogia, Vandana Tomar, Gurpreet Kaur Sidhu, Rajesh Mehrotra et Sandhya Mehrotra
Les plantes dérivent des paralogues de gènes après une duplication à petite échelle (SSD) et une duplication du génome entier (WGD). On sait que les plantes conservent les gènes dupliqués et enrichissent leur répertoire de gènes, ce qui contribue de manière intensive à l'évolution de leurs génomes. L'opinion générale est que ces paralogues sont à la fois sélectionnés et préservés au cours de l'évolution parce qu'ils expriment des niveaux variables de protéines dans différents schémas temporels et spatiaux. Chez Arabidopsis thaliana, les paralogues impliqués dans la signalisation et la régulation transcriptionnelle sont très souvent conservés après des événements de duplication de gènes et de génomes. Nous avons analysé les événements de duplication d'un gène transporteur de nitrate primitif NTR à travers le génome d'Arabidopsis thaliana. La majorité des paralogues ont acquis la fonction de transporteurs de nitrate à haute, basse et double affinité, certains étant régulés par les niveaux de nitrate eux-mêmes et impliqués dans une variété de fonctions végétales telles que le développement embryonnaire, la répression de l'initiation des racines latérales, l'ouverture stomatique, le transport du xylème et du phloème et la réponse aux blessures, etc. Pour la présente analyse, 19 séquences de protéines de transport de nitrate ont été récupérées de la base de données TAIR et analysées par un outil de service Web PINDA ainsi que manuellement, ce qui a donné des résultats analogues. Plusieurs transporteurs se sont avérés agir comme des paralogues car une homologie de séquence étroite a été observée entre eux. Les résultats suggèrent que la sous-fonctionnalisation des protéines de transport de nitrate dans les plantes supérieures s'est produite à la suite d'une série d'événements de duplication de gènes.
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