Journal de physiologie et pathologie végétales

Développement et validation de marqueurs EST-SSR chez Gymnema sylvestre R.Br.

Kuldeepsingh A. Kalariya, Lipi Poojara, Dipal Minipara, Parmeshwar Lal Saran, Ram Prasnna Meena, Sinora Macwan, Ponnuchamy Manivel

Connu pour ses propriétés antidiabétiques, le Gymnema sylvestre appartenant à la famille des Asclepiadaceae est originaire des forêts du sud de l'Inde. On le trouve également en Afrique tropicale et en Australie. Toutes les parties aériennes de cette plante contiennent des alcaloïdes, des flavones et des saponines, mais les feuilles sont principalement utilisées pour ses propriétés médicinales. La diversité basée sur les profils morphologiques, anatomiques et chimio-profils, et les marqueurs RAPD (Randomly Amplified Polymorphic DNA) et ISSR (Inter Simple Sequence Repeats) est rapportée cependant, la diversité génétique au niveau moléculaire à travers les marqueurs les plus efficaces, les marqueurs EST-SSR (Expressed Sequence Tag-SSR) fait défaut dans cette plante. Une énorme quantité de données transcriptomiques a été générée et 5276 loci SSR ont été identifiés dans cette étude. La fréquence des SSR chez Gymnema sylvestre était de 1/12,16 kB. Les répétitions AAG/CTT étaient près de dix fois plus élevées que les répétitions CCG/CGG. Au total, 40 paires d'amorces ont été synthétisées et 27 d'entre elles ont donné une amplification polymorphe dans 25 génotypes de G. sylvestre collectés dans différentes régions de l'Inde. Les génotypes DGS 16 et DGS 34 étaient les génotypes les plus différents. Il s'agissait de la première étude révélant une diversité génétique et des polymorphismes élevés chez G. sylvestre à l'aide de marqueurs EST-SSR ayant un taux de transfert plus élevé de 67,5 %. La distribution désordonnée des génotypes du même état dans différents groupes a été signalée, ce qui peut être dû au fait que G. sylvestre est une plante médicinale importante que les gens utilisent depuis l'Antiquité et il est présumé qu'elle aurait migré vers différents endroits.