Journal de physiologie et pathologie végétales

Virus de la mosaïque du manioc au Ghana : répartition et propagation

Allen Oppong, Ruth Naa A Prempeh, Linda Appianimaa Abrokwah, Esther Afoley Annang, Esther Agyeman Marfo, Zipporah Appiah Kubi, Nana AO Danquah, Augustine Agyekum, Benedicta Nsiah Frimpong, Andrews Sarkodie Appiah, Joseph NL Lamptey, Moses Brandford Mochiah, Justin S Pita

Le manioc est une culture de base importante dans la plupart des tropiques, y compris au Ghana. La productivité de la culture est en proie à des attaques de ravageurs et de maladies. Avec l'émergence de souches virulentes du virus de la mosaïque du manioc (CMV), des enquêtes régulières sont nécessaires pour déterminer la prévalence du CMV et de ses vecteurs d'aleurodes dans les champs des agriculteurs afin de contribuer à la gestion de la maladie du CMV affectant la culture. Des enquêtes sur le terrain ont été menées en septembre et octobre 2015 et de décembre 2016 à janvier 2017 en utilisant un protocole d'échantillonnage harmonisé développé par West African Virus Epidemiology (WAVE) pour les projets sur les racines et tubercules. Trois cent quatre-vingt-treize champs ont été visités dans tout le Ghana et 11 760 échantillons de feuilles de manioc ont été examinés. Les aleurodes ont été comptées sur 5 plantes/champ. Les échantillons malades présentant divers symptômes collectés ont été analysés par PCR et séquençage génomique. Les symptômes de la maladie de la mosaïque du manioc (CMD) ont été enregistrés dans environ quatre-vingt-seize pour cent (96,4 %) des champs étudiés avec une gravité variable. Français Ces symptômes comprenaient une mosaïque foliaire, une déformation/torsion des feuilles, une malformation, des feuilles filiformes, un rabougrissement et une chlorose. Les cultivars à pétiole rouge étaient les plus répandus tandis que ceux à pétiole vert étaient les moins répandus. Aucune aleurode n'a été trouvée sur les cultivars à pétioles violets et verts, tandis que les cultivars à pétioles vert rougeâtre avaient le plus grand nombre d'aleurodes/plante. Les régions de l'Upper West et de l'Upper East avaient la plus petite quantité d'aleurodes/plante. Les isolats ghanéens se sont regroupés avec les isolats du virus de la mosaïque du manioc d'Afrique de l'Est du Cameroun (EACMCV) dans une analyse de groupe. L'analyse BLASTn du fragment de 513 pb de l'ADN-B de l'isolat ghanéen GH07216 a montré une similarité de 89,9 % avec les isolats EACMCVGhana et une identité de 90,54 % avec l'EACMCV-Côte d'Ivoire. De même, l’isolat ghanéen GH07216 a montré une identité de séquence nucléotidique de 95,8 % avec l’isolat EACMCV-Ghana et de 94,22 % avec l’isolat EACMV-Côte d’Ivoire. Les séquences nucléotidiques de l’ADN-A des isolats ghanéens étaient moins variables : entre 95,90 et 96,73 % par rapport aux séquences déjà publiées par rapport à une gamme de séquences CMG disponibles sur GenBank. L’étude a mis à jour la littérature existante sur l’incidence de la CMD, ce qui peut contribuer au développement de variétés de manioc résistantes à la CMD au Ghana.