Le processus évolutif peut être projeté comme un arbre phylogénétique, et la localisation des organismes sur l'arbre est basée sur une structure de la séquence dans laquelle les événements évolutifs se sont produits. La phylogénie vise à améliorer notre compréhension des processus biologiques fondamentaux en permettant aux scientifiques d'avoir une vision claire de la recherche en génomique fonctionnelle. La phylogénétique traite de l'analyse des relations évolutives entre des groupes d'organismes et des techniques de simulation informatique pour l'étude des systèmes biologiques, comportementaux et sociaux.