Les microbes végétaux peuvent être utiles, mais les micro-organismes nuisibles dépendent des plantes pour leur croissance et leur survie. Des interactions pathogènes, symbiotiques et associatives se retrouvent dans les plantes. Des interactions plantes-microbes efficaces et bénéfiques sont nécessaires pour la tolérance au stress, la résistance aux maladies et la productivité des plantes. La caractérisation par isolement des microbes végétaux potentiels est nécessaire pour le contrôle biologique de différentes maladies des plantes.