La colonisation et l'association de bactéries utiles avec le système végétal permettent une croissance saine des plantes. Ces flores bactériennes confèrent une résistance induite, améliorent la fixation de l'azote, la croissance des plantes (phytohormones) et facilitent la synthèse de métabolites antagonistes des pathogènes et parasites nuisibles des plantes. Les interactions végétales bactériennes et fongiques offrent une contribution unique aux processus biotechnologiques et aux cycles biogéochimiques.