La technique assistée par marqueurs, également appelée sélection assistée par marqueurs (MAB), évite ce problème en utilisant des marqueurs génétiques liés au caractère souhaité. Une fois qu’ils sont capables d’identifier une séquence génétique toujours liée à la résistance aux maladies, ils le peuvent. La MAS peut être plus efficace, plus efficace et plus fiable que la sélection phénotypique. De plus, la MAS peut réduire considérablement le temps de développement des variétés, de sorte que dans certains cas, elle sera plus rentable que la sélection basée sur les phénotypes. Les MAS permettent également la sélection de caractères complexes impossibles à réaliser avec les méthodes conventionnelles précédentes. Bien qu’elle ne soit certainement pas la solution miracle à tous les problèmes, la MAS constitue une approche prometteuse de la sélection végétale conventionnelle.