Marisa Manzano, Lucilla Iacumin, Cristina Giusto, Francesca Cecchini, Chiara Patthey, Ramon Fontanillas et Giuseppe Comi
Utilisation de l'électrophorèse sur gel à gradient dénaturant (DGGE) pour évaluer le microbiote intestinal de la truite brune Salmo trutta fario
La flore microbienne présente dans l'intestin du poisson joue un rôle important, comme la dégradation des aliments ingérés, ou l'inhibition de la colonisation de l'intestin du poisson par des pathogènes. Parce que seul un faible pourcentage de micro-organismes présents dans l'eau de mer et l'eau douce peut être cultivé en laboratoire, des techniques moléculaires basées sur l'amplification de l'ADNr 16S ont été développées pour détecter et identifier les bactéries cultivables et non cultivables. De nombreuses études ont combiné des méthodes traditionnelles avec des méthodes moléculaires pour fournir des informations plus détaillées sur les communautés microbiennes. L'objectif de ce travail était d'évaluer le microbiote de l'intestin de Salmo trutta fario, en utilisant la PCR-électrophorèse sur gel à gradient dénaturant (DGGE), pour évaluer l'influence d'un régime alimentaire sur la composition de la population.
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