Journal des sciences vétérinaires et du diagnostic médical

Sur la classification des lyssavirus

Zhu S, Li H, Liang L, Huang W, Ding Y et Guo C

Sur la classification des lyssavirus

Le genre Lyssavirus appartient à la famille des Rhabdoviridae et comprend les virus responsables de la rage encéphalique mortelle . Les analyses phylogénétiques antérieures des lyssavirus étaient principalement basées sur la séquence partielle de la nucléoprotéine ou sur des séquences de gènes concaténés. Avec l'identification récente de nouvelles espèces et la disponibilité de leurs séquences génomiques complètes, une révision de la taxonomie et de la classification des Lyssavirus est souhaitable pour comprendre les relations phylogénétiques au sein des Lyssavirus. Nous proposons ici une nouvelle classification des Lyssavirus par comparaison du génome complet ou de la séquence des gènes de la nucléoprotéine comprenant les 15 lyssavirus actuellement identifiés. Selon cette proposition, la classification mise à jour des Lyssavirus devrait inclure quatre phylogroupes : phylogroupe I (virus de la rage, virus de Duvenhage, lyssavirus de la chauve-souris européenne de types 1 et 2, lyssavirus de la chauve-souris australienne, virus de Khujand, lyssavirus de la chauve-souris de Bokeloh, virus d'Irkut et virus d'Aravan), phylogroupe II (virus de la chauve-souris de Lagos, virus de Mokola et virus de la chauve-souris de Shimoni), phylogroupe III (virus de la chauve-souris du Caucase occidental) et phylogroupe IV (lyssavirus d'Ikoma et lyssavirus de la chauve-souris de Lleida).