L'électrophorèse sur gel est une méthodologie permettant de séparer et d'analyser les macromolécules (ADN, ARN et protéines) et leurs fragments en fonction de leur taille et de leur charge. Cette technique influence principalement en chimie clinique la séparation des protéines par charge ou taille, en chimie organique et en biologie pour séparer un mélange population d'acide désoxy-ribonucléique et de fragments d'acide ribonucléique par longueur, pour estimer la taille des fragments d'ADN et d'ARN ou pour séparer les protéines par charge. Il utilise un gel comme milieu d'électrophorèse anti-convectif, le mouvement d'une particule chargée dans un champ électrique par lequel les gels suppriment la convection thermique provoquée par le champ électrique, et comme milieu de tamisage, retardant le passage des molécules ; les gels peuvent aussi simplement servir à maintenir la cloison terminée, afin qu'une coloration post-électrophorèse puisse être appliquée.