La phylogénétique est l'étude de la phylogénie, ou de l'histoire évolutive, du développement et des relations entre des groupes d'organismes (par exemple, des espèces ou des populations). Ceux-ci sont découverts grâce à des données de séquençage moléculaire et à des matrices de données morphologiques ou à des informations sur les attributs physiques de diverses espèces à différents moments. Les arbres phylogénétiques illustrent les relations évolutives entre des groupes d'organismes ou entre une famille de séquences d'acides nucléiques ou de protéines apparentées. La phylogénétique traite principalement des caractéristiques physiques ou morphologiques telles que la taille, la couleur, le nombre de pattes, etc. La phylogénie moderne utilise des informations extraites du matériel génétique, principalement des séquences d'ADN et de protéines. Les caractères utilisés sont généralement les sites ADN ou protéiques. Les relations entre espèces sont ensuite déduites de blocs bien conservés dans l'alignement de plusieurs séquences, une pour chaque espèce examinée.
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