La modélisation moléculaire permet aux scientifiques d'utiliser des ordinateurs pour visualiser des molécules, ce qui signifie représenter numériquement les structures moléculaires et simuler leur comportement avec les équations de la physique quantique et classique.
L'objectif de la modélisation moléculaire est de développer un modèle suffisamment précis du système pour que l' expérience physique ne soit pas nécessaire.
La modélisation moléculaire s'est développée au cours des dernières décennies à partir d'un outil de visualisation de bases de données tridimensionnelles .