La biologie et la biochimie des sols décrivent et expliquent les processus biologiques se produisant dans le sol. Il s’agit notamment des applications possibles de ces connaissances aux questions de qualité des sols et de l’environnement – dans la mesure où ces études éclairent notre compréhension du rôle de la biologie et de la biochimie des sols dans la médiation des fonctions des sols, de la durabilité agricole et des services écosystémiques. L'écologie et les processus biochimiques des organismes du sol, leurs effets sur l'environnement et leurs interactions avec les plantes sont des sujets majeurs. Les applications de nouvelles techniques moléculaires, microscopiques et analytiques pour comprendre et expliquer la dynamique des populations et des communautés présentent un grand intérêt. La biochimie du sol, qui est une sous-discipline de la science du sol, traite de la décomposition et de la synthèse de la matière organique dans le sol et de diverses réactions biochimiques, activités et produits de micro-organismes dans le sol impliquant l'azote, le carbone, le phosphore, les métaux, les xénobiotiques et le soufre. Il s’agit simplement de la biochimie à l’interface sol-plante. L'application des principes de la biochimie à la protection de l'environnement est la principale préoccupation de la biochimie environnementale. Les thèmes principaux incluent la gestion de la qualité de l'eau et des ressources atmosphériques, la protection contre les radiations, le maintien de l'hygiène industrielle, etc. Les biochimistes environnementaux utilisent les organismes vivants et leurs capacités à ces fins.