Journal de génie informatique et des technologies de l'information

Comparaison de séquences, classification et phylogénie : éviter les hypothèses cachées et accélérer les analyses

Soares I et Amorim A

Comparaison de séquences, classification et phylogénie : éviter les hypothèses cachées et accélérer les analyses

Une phylogénie est une synthèse des événements évolutifs qui ont dérivé d'un génome ancestral commun produisant la diversité actuellement connue. Au cours des dernières décennies, de nombreuses approches ont été développées afin de résoudre le problème de la reconstitution de la phylogénie. Néanmoins, la reconstruction du processus évolutif reste un défi sérieux en raison de la complexité des événements conduisant aux changements de séquences d'acides nucléiques. Le processus de reconstruction de la phylogénie dépend entièrement de la qualité de l'étape de comparaison des séquences, qui reste un grand défi pour la communauté scientifique à ce jour, mais aussi de la modélisation des mutations responsables des changements.