Les infections de l'appareil reproducteur (ITR) comprennent trois types d'infection : a) les maladies sexuellement transmissibles (MST), telles que la chlamydia, la gonorrhée, le chancre mou et le virus de l'immunodéficience humaine (VIH) ; b) les infections endogènes, causées par la prolifération d'organismes normalement présents dans le tractus génital des femmes en bonne santé, telles que la vaginose bactérienne ou la candidose vulvo-vaginale ; et c) les infections iatrogènes, associées à des procédures médicales mal exécutées telles qu'un avortement à risque ou de mauvaises pratiques d'accouchement.
Les infections de l'appareil reproducteur féminin, en particulier les infections génitales inférieures, sont largement traitées et peuvent survenir dans l'appareil reproducteur supérieur, qui comprend les trompes de Fallope, l'ovaire et l'utérus, ou dans l'appareil reproducteur inférieur, qui comprend le vagin, le col de l'utérus et la vulve.
Les infections de l'appareil reproducteur masculin ont les causes suivantes : prostatite, épididymite, orchite, pyélonéphrite, cystite, urétrite et cathéters urinaires.